Etablissement public de santé, le CHU relève du Ministère chargé de la Santé. Il est doté d'un Conseil de surveillance et dirigé par un directeur général, assisté d'un directoire.

Le directeur général assure la gestion et la conduite générale de l'établissement. Il a autorité sur l'ensemble du personnel, ordonne les dépenses et les recettes et est responsable du bon fonctionnement de tous les services.

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